新生儿胎粪吸入综合征的治疗的时间，要根据新生儿自身病情的严重程度而定，一般治疗时间约在1-2周之间。如果胎粪吸入综合征临床症状比较轻，不需要呼吸机支持治疗，一般经过一周左右的治疗就可痊愈。
如果胎粪吸入合并有呼吸窘迫综合征，或者是有肺气漏以及重症的肺部感染，则需要呼吸机支持治疗，要等待撤离呼吸机及感染控制，病程至少在两周左右，甚至更长时间。