流行性角结膜炎通常是由致病细菌感染引起来的结膜及角膜炎症。对于这类疾病的治疗，通常需要给予局部抗生素控制局部感染。在疾病早期选取敏感抗生素滴眼液如盐酸左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等频繁点眼，点眼的频率随病情轻重增减。如累及角膜，出现角膜上皮受损，可以给予促角膜上皮修复药物，如重组牛碱性成纤维细胞生长因子滴眼液。