肾囊肿囊壁钙化的治疗取决于肾囊肿是否进行治疗，肾囊肿是肾脏最常见的良性肿瘤，随着年龄的增长会逐渐增大，在增长的过程中，会因为炎症或者出血而出现囊壁钙化，通常情况下对于囊肿＜4cm者，不进行特殊的治疗，以观察为主，每半年到一年进行一次超声检查，观察肾囊肿及其囊壁钙化的情况和增长速度等。
一旦肾囊肿增大超过了4cm以上，伴随有明显的症状时，如腰疼、血尿、泌尿系感染等，可以在进行消炎治疗的同时，做囊肿的引流手术。