脑血吸虫病患者都有曾去过血吸虫疫区并有与血吸虫疫水接触史，因此应当积极做好防护，避免与疫水接触，做好个人防护，保持饮食环境卫生。同时，平时应积极提高个人免疫力，饮食营养，锻炼身体，防止因免疫力低下而患病。
1、控制传染源：处于流行区的人群，定期进行体检，避免感染的情况出现。
2、切断传播途径：血吸虫常寄生在钉螺上，因此日常生活中避免食用钉螺，同时注意食品以及饮用水的干净卫生。
3、保护易感者人群：应积极了解该病的基本信息，在日常生活中加强锻炼，提高机体免疫力，对于难以避免接触疫水者，可使用防护器具，如穿长统胶靴。