细菌感染主要采取抗菌药物治疗，还可辅以一般治疗、物理治疗，必要时行手术治疗，治疗目的彻底杀灭细菌，缓解症状、维持脏器功能。
一、一般治疗
1、出现呼吸困难、气促时，需进行辅助通气治疗，包括鼻导管吸氧、面罩吸氧，必要时需进行气管插管或气管切开。
2、高热时可采取物理降温，包括用冷毛巾、冰袋、退热贴等置于患者前额头顶部和体表大血管流经处进行散热；也可以采用温水擦浴进行降温。
二、药物治疗
细菌感染时应尽早查明感染病原，根据病原种类及药物敏感试验结果选用抗菌药物，如在等待药敏结果过程中，可根据当地细菌耐药监测数据经验性选择抗生素治疗，常用药物有：
1、β-内酰胺类：包括青霉素、头孢菌素、碳青霉烯类等。
2、大环内酯类：包括红霉素、阿齐霉素及罗红霉素等。
3、氨基糖苷类：链霉素、庆大霉素、卡那霉素以及人工半合成的妥布霉素、阿米卡星等。
4、四环素类：四环素、多西环素及米诺环素等。
5、喹诺酮类：左氧氟沙星、环丙沙星、莫西沙星等
6、其他抗生素：如万古霉素、林可霉素、磺胺类、利奈唑胺、磷霉素以及抗结核药物（异烟肼、利福平、乙胺丁醇以及吡嗪酰胺等）。
三、手术治疗
若细菌感染出现脓肿，则需根据情况采取手术治疗，目的为引流脓液，，若部分组织因严重感染出现坏死，则需根据情况进行手术切除坏死组织。