发病机制尚不明了，是一种多因素的疾病，其发病主要与性激素水平、皮脂大量分泌、痤疮丙酸杆菌增殖、毛囊皮脂腺导管的角化异常及炎症等因素相关。其中免疫学因素可能更主要，机体对病原微生物的高度敏感是可能因素之一。
1、内分泌因素：患者青春期发病、青春期后减轻或自愈，雄性激素在痤疮的发病中起重要作用。
2、毛囊皮脂腺导管角化异常：毛囊皮脂腺导管角化过度，导管口径变小、狭窄或阻塞，则影响毛囊壁脱落的上皮细胞和皮脂的正常排出，形成粉刺。
3、感染因素：早期的痤疮并无感染，皮脂主要在痤疮丙酸杆菌(PA)脂酶的作用下，经过一系列的反应，介导炎症反应，损伤毛囊壁并使其破裂。后期可因细菌感染引起炎症，出现丘疹、脓疱、结节和脓肿。
4、免疫学因素：部分患者的血清中IgG水平增高，此外痤疮丙酸杆菌在体内产生循环抗体至局部参与早期的炎症反应。
5、其他因素：除上述因素外，遗传因素可影响临床类型、皮损分布和病程长短。饮食因素如脂肪、糖类、可可等可改变表面脂类成分或增加皮脂的产生。刺激性食品如辣椒、烈性酒、油炸食品等可使皮损加重。过度劳累、情绪紧张等精神因素可使病情加重。