当甲状舌管囊肿位于舌骨以上，并且肿块比较小的时候，可以没有症状。随着囊肿的增大，可以出现舌部发胀，咽部异物感，发音不清等情况。另外，患者经常因为颈部出现肿块，影响外观而产生自卑的心理。在囊肿发生感染的时候，局部有红肿，疼痛，皮温升高，从而进一步影响到日常的生活和工作。一旦甲状舌管囊肿，破溃形成瘘之后，瘘口持续有分泌物外溢，会给生活带来非常的大的不便。