菜花状疣最快速有效的治疗方法是液氮冷冻治疗和二氧化碳激光治疗，能够快速去除疣体，恢复期也比较短。不方便做治疗的可以涂抹外用药物，常用药物有咪喹莫特乳膏、斑蝥素乳膏、三氯醋酸等，这些药物都有一定程度的刺激性，使用时剂量一定要小。反复发作的菜花状疣可以采用艾拉光动力治疗，大约每周一次，需要做4-6次。也可以先用冷冻或激光治疗，然后做光动力预防复发。