1、胸部X线：轻症患者可发现或仅见一侧或两侧下肺有局限性肺纹理增多、增粗现象。合并感染时在阴影内可出现液平，后期患者可见有多个不规则环状透亮阴影或沿支气管的蜂窝状或卷发样阴影。
2、血液检查：可判断患者是否存在细菌感染，白血病计数一般正常，有继发感染时可增高。
3、痰培养：判断致病微生物，如肺炎双球菌、葡萄球菌、绿脓杆菌、流感嗜血杆菌、克雷白杆菌等，可帮助医生选择细菌敏感的抗生素。
4、纤维支气管镜检查：可以确定是否存在异物吸入或气道内肿瘤，也可协助吸出气道内粘痰，以利于感染的控制。
5、血气分析：有助于判断患者是否存在呼吸衰竭及其严重程度。
6、鼻旁窦摄片检查：判断患者是否合并鼻窦炎。
7、血中免疫球蛋白水平测定：检测患者是否有免疫缺陷。
8、汗液内盐分测定：囊性纤维化患者此项检查会出现异常。
9、精液检查：怀疑纤毛不动综合征的患者需要进行此项检查。