面偏侧萎缩症病因及发病机制尚不明确，一般认为和自主神经系统的中枢性或周围性损害有关。
一、主要病因
本症的原因尚未明了，由于部分病例伴有包括Horner综合征在内的颈交感神经障碍的症状，一般认为和自主神经系统的中枢性或周围性损害有关，其他学说牵涉到局部或全身性感染、损伤、三叉神经炎、胶原性疾病、遗传变性等。
二、诱发因素
1、外伤：由意外创伤或手术而造成的面部神经肌肉受损，从而导致面部萎缩。
2、家族遗传：面偏侧萎缩症与家族遗传有关，若有家族遗传史的人群，较容易患本病。