巴氏腺囊肿的手术费用大约是在3000元左右。手术的费用主要包含三个部分：第一术前的检查费用，主要包括血常规、血型、凝血功能、四病抗体、血糖、心电图等等，要排除手术的禁忌才可以做手术。花费大约在1000元左右。第二部分主要是手术的费用，主要包括手术费以及手术中所使用的材料费用，花费大约在1000元左右。第三部分主要是术后治疗，因为巴氏腺囊肿需要切开造口，为预防切口过早闭合必须要在刀口处填塞油纱，大约需要换药六到七次。包含床位护理费在内大约需要一千元。