其临床表现为，夏秋季高发儿童多见，急性起病，出现病毒感染全身中毒症状，如发热、畏光、肌痛、食欲减退、腹泻和全身乏力，脑膜刺激征如头痛、呕吐、轻度颈强和克尼格征等。患儿病程超过一周，成年可持续两周或更长，表现因患者年龄，病毒种类而不同。幼儿可见发热，呕吐和皮疹等，颈强较轻，肠道病毒71型脑膜炎常见手足口综合征，埃可病毒9型脑膜炎，常见非特异性皮疹。