多囊肾治疗分为传统治疗和新型治疗。传统治疗即多囊肾进展监测，早期干预(包括药物和非药物治疗)抑制肾囊肿生长来减少慢性肾脏病进展的风险因素。通过早期应用血管紧张素转换酶抑制剂减少心血管疾病的发病率和缓解肾小球内高压。新型治疗包括：AVPV2R拮抗剂:如托伐普坦，目前仅在日本和欧洲进行推广。其他如:mTOR抑制剂(西罗莫司、依维莫司)、生长抑素类似物(奥曲肽)、他汀类药物(普伐他汀）、雷公藤提纯物(雷公藤甲素)目前研发状态处于II期尚未进行推广。