小儿甲状腺机能减退症及早治疗预后比较好。先天性甲状腺机能减退症，如果在患儿出生两周内开始治疗，大部分患儿的神经系统发育和智力水平能恢复正常，但是如果在新生儿期不能及时发现和开始正确的甲状腺制剂治疗，会导致儿童智力低下，进而影响儿童的日后生活质量。首选为左甲状腺素钠片，是以每公斤体重给予1.6到1.8微克，起始剂量，每天一次，早空腹口服。一个月复查一次甲状腺功能，根据甲状腺功能来增减优甲乐的剂量，直至甲状腺功能达到正常水平。