脑囊虫病的原因最常见是外源性感染，是人体摄入带有被猪绦虫的虫卵污染的食物，或因不良的生活习惯是虫卵被摄入人体内治病，极少见的是内源性的感染即肛门-口腔转移形成的自身感染。脑囊虫病自感染到出现症状，数日至30年不等，常常与囊虫囊虫的数量，大小和感染部位有关。如果是在脑实质才表现为突然的，或者缓慢出现的偏瘫、感觉缺失、偏盲和失语；如果侵犯的是蛛网膜或脑室病情比较重，常因脑积水、颅内压的增高合并意识障碍，甚至死亡。