细支气管肺泡癌治疗原则同非小细胞肺癌。因临床分型、分期而异，主要治疗有局限或孤立病灶可考虑手术、化疗、放疗和EGFR-TKIs特殊治疗，治疗周期较长。
一、药物治疗
1、黏液型细支气管肺泡癌对EGFR-TKIs治疗较为不敏感，可能对紫杉醇化疗较为敏感，但化疗毒副作用高，对此当审慎。
2、非黏液型经过EGFR-TKIs吉非替尼或埃罗替尼治疗后具有较好的预后，尤其对化疗不敏感或表皮生长因子受体突变型细支气管肺泡癌疗效更好
3、包括EGFR-TKIs在内的分子靶向治疗的原则同肺腺癌(非小细胞肺癌)，需要对病理标本或血液进行基因突变的检测，以指导精准治疗。
二、手术治疗
手术原则是完整切除病灶，尽可能保留有功能的肺组织，标准术式为肺叶切除+淋巴结清扫术或者全肺切除+淋巴结清扫术。多结节病灶型细支气管肺泡癌如能做到完全性切除当积极手术治疗；孤立结节型细支气管肺泡癌可行楔形切除术；细支气管肺泡癌易于复发，一般主张术后每半年复查CT一次，肿瘤复发者多数仍可手术，甚至反复多次手术，再次手术不增加手术死亡率，但可获长期缓解甚至治愈。
三、放射治疗
对晚期的细支气管肺泡癌，可采用组织基因检测，如相应靶点为阳性，可考虑应用表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)等靶向药物。
四、其他治疗
肺移植：恶性肿瘤原则上不宜做肺移植，只有极少部分的细支气管肺泡癌能从肺移植中获益。