由于脑脊液是在脑室、蛛网膜下腔、脊髓中央管循环，有些疾病，比如脑膜炎、脑炎、脑肿瘤等可通过腰椎穿刺留取脑脊液标本进行化验，也可通过腰椎穿刺测定颅内压力或排除蛛网膜下腔是否有梗阻等。由于腰椎穿刺时有脑脊液流出，留取标本也需要一定量的脑脊液，而脑脊液循环是需要一定时间的，腰穿后可能会引起颅内压力过低，导致低颅压症状，比如出现头痛等不适，因此，腰椎穿刺后需要去枕平卧6小时，同时多喝水，均是为了预防低颅压症状的出现。