慢性胆囊炎的治疗包括去除病因、缓解症状、预防复发，以及预防、治疗并发症。从饮食上应该建议规律的低脂、低热量饮食，并且提倡定量、定时的规律饮食方式。对于有症状的患者如果不宜手术，并且经过腹部B超的检测显示胆囊功能正常，X检查是阴性胆固醇的结石，也可以给予口服药物溶石治疗。常用的药物是熊去氧胆酸，可以做腹部B超来明确药物是否有效。
对于消化不良症状为主的慢性胆囊炎患者，可以补充促进胆汁分泌和消化酶类药物，比如复方阿嗪米特，可以缓解症状。对于以腹痛为症状的患者，主要可以给钙离子通道的拮抗剂来缓解症状，比如匹维溴铵。如果是慢性胆囊炎的急性发作，这时候可能就按急性胆囊炎来处理，最主要的是给抗菌药物。如果慢性胆囊炎反复出现，影响了生活，并且如果出现了胆囊壁的逐渐增厚，大于4mm以上，或者胆囊壁逐渐的不规则增厚，怀疑有胆囊癌的患者，甚至出现了胆囊结石的嵌顿，有可能还需要手术的治疗。如果慢性胆囊炎合并胆囊息肉，息肉大于1cm也有癌变的可能，这时候同样也是需要手术的治疗。