支原体肺炎早期使用适当抗生素，可减轻症状及缩短病程。本病具有自限性，有些症状较轻的患者不经治疗可自愈。如果症状持续或加重可以在医生指导下服用药物，疗程一般2-3周，大环内酯类抗生素为首选，如红霉素、罗红霉素和阿奇霉素，对大环内酯不敏感者则可选用呼吸氟喹诺酮类，如左氧氟沙星，四环素类也用于肺炎支原体的治疗。