婴儿膝盖有凹陷，常见以下几个方面的原因：
第一、先天性膝关节发育不全：这种情况下婴儿一般会伴有下肢活动异常，需要及时带婴儿到正规医院就诊，拍摄膝关节X线片明确诊断。
第二、膝过伸：有一部分婴儿膝盖有凹陷，可能是由于膝过伸造成。
第三、缺钙：可导致骨质软化，除了出现膝盖处凹陷外，还会伴有夜间睡眠不安稳、频繁夜间惊醒、哭闹、多汗、枕秃、方颅、鸡胸、漏斗胸、肋缘外翻、颅骨软化等症状。需要带婴儿到正规医院化验血钙和维生素D水平。如果确实存在缺钙或缺乏维生素D，要积极补充。同时让婴儿多晒太阳，促进钙的吸收。当维生素D和钙补充充足之后，婴儿膝盖有凹陷的症状会逐渐改善。