原发性甲状腺功能减退甲功的指标主要表现甲状腺激素水平降低。
促甲状腺激素水平增高，原发性甲状腺功能减退，是甲状腺本身受到了损伤，甲状腺手术切除或者是甲状腺自身免疫性炎症破坏，以及碘-131治疗甲亢，甲状腺合成分泌甲状腺激素减少。
通过测定甲状腺激素水平有助于诊断，原发性甲状腺功能减退可以是甲状腺激素减少，促甲状腺激素水平增高。
同时还可以通过甲状腺自身抗体来了解原发性甲状腺功能减退的病因，是否是自身免疫性损伤所致。原发性甲状腺功能减退的治疗，是用左甲状腺激素替代治疗。
在治疗期间，定期的复查甲状腺功能的水平，有助于调整药物，患者不能自行减药或停药。