对于肠壁水肿增厚的预防，除了肠壁水肿增厚本身，还应预防可能导致肛门疼痛的病因及诱因。具体预防方法可参考如下几点：
1、坚持锻炼身体，促进肠蠕动，促进排便，减轻胃肠负担。
2、养成良好的饮食规律，多吃富含纤维及维生素的食物，少吃刺激性食物。
3、避免过于神经疲劳，如长期压力过大、过度劳累、情绪低落、精神紧绷等。
4、积极治疗容易引起肠壁水肿增厚等疾病的基础疾病，如系统性红斑狼疮、结节性多动脉炎、皮肌炎等全身疾病。
5、中老年患者出现肠壁水肿增厚，若同时伴有大便性状及排便习惯改变时应及时就诊。同时，建议定期检查肠镜。