矮小症的原因相对来说比较复杂，常见原因有以下几个方面：
1、遗传因素：比如孩子的父母双方至少有一人身材矮小，这种情况下，孩子出现身材矮小的几率就会明显高于同龄的孩子；
2、生长发育迟缓：比如在妊娠期间存在宫内发育迟缓，或者是出生的时候存在早产或者是双胎、多胎，这种情况下身高就会明显落后于同龄的孩子；
3、生长激素缺乏：导致孩子出现身材矮小，在这种情况下，一般常见有特发性的生长激素缺乏症；
4、其他因素：还有一部分孩子可能是由于营养不良所造成。