浅层点状角膜炎的发生与角膜损伤有一定关联，因此，预防该疾病可通过预防角膜损伤入手，此外，该疾病的发生也与佩戴角膜接触镜有一定联系，正确使用角膜接触镜也能预防该病的发生。
（1）佩戴角膜接触镜者应当在正规场所进行验配，选择质量好的角膜接触镜，按照使用说明正确佩戴角膜接触镜，减少佩戴时间，在佩戴后认真清洁角膜接触镜，尽量选择日抛型角膜接触镜，定期更换角膜接触镜，定期检查角膜及眼表情况。
（2）特殊职业者应注意用眼卫生，选择质量好的防护器具，确保作业安全。