肾囊肿的发病机制和病因不清楚，无法有效规避肾囊肿。肾囊肿是肾小管憩室所形成，随着年龄的增长，肾囊肿逐渐增多，形成肾多发囊肿。肾囊肿一般预后好，不会引起高血压、血尿、肾功能下降。
肾囊肿需要和多囊肾进行鉴别，多囊肾是一种遗传性疾病，有家族史，可引起血尿、高血压、肾功能下降，可以通过肾脏CT、磁共振进一步排查。多囊肾一旦出现了肾功能下降，就呈慢性进行性进展疾病，直至肾衰竭的终末期尿毒症期。一旦出现了尿毒症的症状，比如恶心、呕吐、食欲减退、胸闷、气促、呼吸困难，出现了尿毒症脑病的表现，精神错乱、幻觉、昏迷，出现了严重的代谢性酸中毒，出现了重度贫血，贫血难以纠正，出现感染，感染难以控制，此时需要进行肾脏替代治疗，如血液透析或者腹膜透析治疗。