神经肽性肢端感觉异常的治疗以外用药物治疗为主，多使用辣椒辣素霜外用控制患者症状。患者需要避免对病损的过度搔抓，以造成皮肤破损引起继发损害。
一、一般治疗
避免搔抓、刺激皮肤，以免出现继发性皮疹，从而引起继发性的皮肤感染，同时搔抓出现皮疹会影响疾病的判定。
二、药物治疗
辣椒辣素冷霜：辣椒辣素冷霜是外用药物，在皮肤病变处涂抹0.25%辣椒辣素冷霜，2周内症状可完全消失。辣椒辣素一定程度上可以阻碍神经肽的储存和释放，具有消炎止痛的功效，保证皮肤病变处神经肽纤维恢复正常。
三、手术治疗
神经肽性肢端感觉异常无需手术治疗。