1、实验室检查：急型和亚急型患者血沉多增快，白细胞总数及中性粒细胞数常升高，可见血清天冬氨酸转氨酶（AST）、丙氨酸转氨酶（ALT）、肌酸磷酸激酶（CK）、乳酸脱氢梅（LDH）、心肌肌钙蛋白T及I及血清肌红蛋白活性增高。慢型患者AST/ALT<1，而急型患者>1，说明前者为肝瘀血所致，而后者为心肌损伤所致。此外，抗心肌抗体、抗核抗体及循环免疫复合物也明显增高。部分患者血清中肠道病毒IgM明显升高，血及心肌等标本中肠道病毒RNA可为阳性。
2、特殊检查：
（1）心电图：潜在型者80%有心电图异常改变，而其他各型几乎均有各种异常心电图变化，经常是多种改变同时并存。心电图异常多表现为心肌损伤、传导障碍和异位心律。心肌损伤以低电位、QT间期延长、原发性ST-T改变和病理性异常 Q波为主。传导障碍以右侧完全性束支阻滞为最多见，异位心律以室性早搏最多见。房颤多见于心脏显著增大患者。
（2）心内膜-心肌活体组织检查：活体组织形态学变化对其诊断，特别是慢型克山病与扩张型心肌病和其他特异性心肌疾病及急型克山病、急性重症病毒性心肌炎鉴别有着重大价值。
（3）心机图：克山病心机图变化主要表现收缩期间与A波等变化。其左室射血前期（PEP）的延长，左室射血期（LVET）的缩短，PEP/LVET增加和 A波率的增高。上述改变与充血性心力衰竭程度成正比。
（4）心导管检查：潜在型患者血流动力学基本正常。慢型有右室、肺动脉及肺毛细血管楔压轻、中度升高，心脏指数下降。急型患者不宜行心导管检查。
3、影像学检查：
（1）X线检查：心脏呈普遍性扩大，横径下移，呈无力的三角形，心脏搏动普遍明显减弱，常有局限性心脏搏动显著减弱乃至消失，少数患者呈反向搏动类似室壁瘤所见。
（2）超声心动图：克山病的超声心动图改变与扩张型心肌病基本相似，主要表现各心腔增大与收缩幅度降低，室壁厚度与扩大心腔对比显示变薄，其程度重于扩张型心肌病。心腔扩大程度与疾病进程成正比，病期越长扩大越显著。