扁桃体的结石不需要特殊的治疗，扁桃体的结石实际是扁桃体隐窝里储存的食物残渣，或者脱落的黏膜上皮形成，实际上是生理现象，并不是病理的，比如扁桃体化脓，需要治疗。有的时候会引起咽炎、异物感，或者可能会有些异味，有时候漱口、轻轻的咳嗽，可能结石就掉出来了。
如果比较困难的时候，可以到医院让医生帮助取出来，但是并没有什么药，可以让它不再生成结石。如果结石真的不胜其烦，可以考虑经常的用淡盐水漱口，让结石升长得慢些。可以早期把它漱掉，再严重极少数的病人可以考虑扁桃体切除。因为没有扁桃体了，自然不会再有结石了。