流行性角膜结膜炎患者在预防时，应在采取预防措施、早期筛查方面做好相应工作。平时应当从做好个人卫生，尤其是养成良好的生活习惯，不徒手触摸眼睑，结膜，勤洗手，当眼睛不适或者眼睛内部进入异物时，最好使用消毒灭菌的洗涤剂清洁手部后再用手指或者医用棉签去除异物；同时也要做好早期筛查，当出现流行性角膜结膜炎的早期症状时就应该及时采取措施。
（1）平时在生活和工作区喷洒消毒液，例如喷洒含碘消毒液对抑制和杀死流行性角膜结膜炎的病原体有显著作用。
（2）使用具有消灭流行性角膜结膜炎的病原体效果的洗手液或者洗手凝胶。
（3）家庭生活中将生活用具浸泡在消毒液中，或用浸泡的纱布擦拭桌面及门窗等，可防止家庭内交叉感染。
（4）疫苗在预防流行性角膜炎的感染上有一定价值，患者可在流行性角膜结膜炎的流行期接种该病的疫苗，可取得较好的预防效果。
（5）注意好眼部卫生，避免揉眼，去公共泳池游泳应注意佩戴好眼镜，避免和其他人共用毛巾等物品。