小儿隐睾手术后遗症一般是睾丸萎缩。导致睾丸萎缩可能是因为手术结束后睾丸血供存在不充分导致的。但后遗症出现的几率是比较小的，大部分患者手术后是不会有什么后遗症的。隐睾手术应该要尽早进行，时间越长，治疗效果可能会越差，部分患者还可能会出现睾丸肿瘤等严重的并发症。手术治疗后如果觉得患处或者身体有什么异常的现象，要及时到医院做处理。