霉菌性外耳道炎可以导致中耳炎，或者慢性化脓性中耳炎合并霉菌性外耳道炎的发生，本病若为急性发作，可短期使用抗生素，冲洗耳道将耳道内的脓液、清洗干净，再使用抗生素滴耳液抗感染。若为真菌感染也可以导致慢性中耳炎的发生，这种情况较少，本病可以通过口服抗真菌药物进行治疗，清理耳道内痂皮，局部涂抹抗真菌药物，保持干耳，使用微波等热疗方式。