脑部脱髓鞘疾病与脑脓肿囊虫的鉴别可以从临床表现，影像学等多方面鉴别，临床表现脑脱髓鞘疾病，会出现时间的多样性与空间的多样性特点。患者有诸多症状，比如头晕，头痛，肢体麻木，乏力，视物模糊，失明，双下肢行走障碍等等。同时有复发，缓解再复发的特点，而脑囊虫是不会有上述表现的，它会出现癫痫，精神异常，恶心，呕吐，而且症状会持续发作，在影像学上，两者鉴别也非常明显，经头颅核磁就能鉴别。