1、1型自身免疫性甲状腺炎：甲状腺功能正常促甲状腺激素水平正常，常有Tg和TPO抗体存在。
2、2型自身免疫性甲状腺炎：持续存在甲减促甲状腺激素水平升高，常有Tg和TPO抗体存在，一些2型伴有阻断型促甲状腺激素受体抗体存在。严重者可能开始表现为暂时的甲状腺毒症，然后经常出现暂时性甲减，但是病人也可表现为暂时性甲减，而没有之前的甲状腺毒症，Tg和TPO抗体存在，如产后甲状腺炎。
3、3型自身免疫性甲状腺炎：甲状腺功能亢进或甲状腺功能正常，促甲状腺激素被抑制，有刺激型促甲状腺激素受体抗体存在，Tg和TPO抗体也常存在。眼病伴有甲状腺功能减低，有诊断水平的刺激型或阻断型促甲状腺激素受体抗体可被发现，常有Tg和TPO抗体存在。