注射用阿昔洛韦可以用于治疗免疫缺陷患者的严重带状疱疹感染，也可以用于免疫功能正常的患者弥散型带状疱疹感染，并且可以用于免疫缺陷病人水痘的治疗。注射用阿昔洛韦还可以治疗急性视网膜坏死，也可以用于初发和复发的生殖器疱疹。注射用阿昔洛韦在使用的时候，要注意静脉滴注方式，给药时应该缓慢滴注，否则容易发生肾小管内药物结晶沉淀，引起急性肾衰竭。在配制成药液之后，静脉滴注时间应当控制在一定时间，并且要避免药液漏在血管外面，引起局部皮肤疼痛和静脉炎。配置的时候药液浓度不应该过高，否则会引起静脉炎症。
要注意，阿昔洛韦静脉输液使用时，可以引发患者精神症状。新生儿使用阿昔洛韦时，不适合使用含苯甲醇的稀释液配制静脉滴注液，否则容易引起致命性综合征，包括中枢抑制、低血压、癫痫和颅内出血，因此新生儿和儿童要慎用阿昔洛韦。由于严重免疫功能缺陷的患者，长期或者多次使用阿昔洛韦，可能会引起单纯疱疹病毒和带状疱疹病毒发生耐药，因此如果患者用药后皮肤损害没有改善，应当测试病毒对阿昔洛韦的敏感性。