上颌窦牙源性囊肿的发生与先天性牙齿缺如或牙根感染、牙髓坏死等牙齿感染性疾病有关，因此应该着重预防牙部感染性疾病的发生，常规进行口腔检查和口腔护理，保持口腔健康。
（1）建议每半年到一年进行口腔检查。
（2）早晚刷牙，养成良好的口腔卫生习惯。
（3）如果患有牙科疾病，应定期检查，及早治疗，避免引发上颌窦牙源性囊肿。
（4）适当运动，增强机体免疫力，预防呼吸道感染。