PD-1治疗即免疫治疗，目前国内外临床上报道，治疗的副作用有发热、腹泻、贫血、转氨酶升高、肾上腺功能不全、腹水、食管静脉曲张破裂出血、低钠血症、血清胆红素升高，以及非感染性肺炎。患者最常见的反应有皮疹、瘙痒、肌肉及骨骼疼痛、腹泻、咳嗽、食欲下降、疲劳、发热、腹痛、头痛、恶心、头晕，还有甲状腺功能减退和体重下降等。
虽然PD-1治疗有上述这么多副作用，但是相比传统的化疗和靶向治疗而言，PD-1治疗副作用还是相对更小，安全性更高。传统的化疗药物在杀伤肿瘤细胞的同时，会连同正常的细胞一并杀死，选择性较差，副作用较大，靶向治疗药物基本都是多靶点阻断，副作用也相对较大。PD-1治疗药物不是直接杀伤肿瘤，而是通过激活自身的T细胞，让自身的免疫性T细胞来杀灭肿瘤，所以副作用相对小，安全性比较高。