食管炎往往是胃跟十二指肠的内容物反流到食管，对食管的黏膜刺激引起食管的红斑、糜烂，甚至溃疡。食管炎的治疗主要分为以下两种：
一、促动力药，包括多潘立酮、莫沙必利，主要是促进食管的廓清运动以及胃的正常排空，从而抑制胃的反流。
二、抑酸药，因为胃内容物尤其是胃酸，对食管黏膜的损伤是最大的。积极的抑酸治疗可以促进食管黏膜炎症的消退，促进溃疡的愈合。目前常用的抑酸药是质子泵抑制剂，包括奥美拉唑、艾司奥美拉唑、雷贝拉唑、兰索拉唑等。
食管炎的用药疗程往往是16-8周，对于部分患者，比如持续负压增高的患者、过度的肥胖、便秘的患者，症状有可能会反复。建议当疗程结束以后，也可以再继续按需服药。