对于本病的治疗，国内外研究表明大肠黑变病呈良性可逆性，在停用泻药后可使黑变的大肠黏膜恢复，但因患者便秘症状的持续时间长、痛苦程度大，停用泻药对患者来说并非易事。
一、一般治疗
停用蒽醌类泻药，改善生活、饮食及排便习惯，加强运动，多吃膳食纤维含量丰富的食物，多饮水。
二、药物治疗
常用药物包括胃肠道动力药物，如吗丁啉、快力以及益生菌培菲康等，还有渗透性泻药。
三、手术治疗
手术治疗主要是针对大肠黑变病并发大肠息肉、大肠腺瘤及大肠肿瘤的患者。合并息肉者经病理检查确诊后，经肠镜行电凝电切术，合并大肠肿瘤者早日行根治性手术治疗。另外，对一些良性疾病，如直肠前突、直肠内套叠等可能引起黑变病的原因，也应给予积极治疗。
四、其他治疗
腹部理疗、针灸治疗等，主要是改善便秘症状。