儿童IgA肾病的发病机制目前还不明确，多数学者认为IgA肾病是一多基因多因素决定的复杂性疾病。多由于细菌、病毒感染或遗传等因素导致大量IgA免疫复合物聚集而导致疾病的发生。好发于有家族遗传史的儿童、自身免疫力差的儿童，上呼吸道感染、某些食物(含有卵白蛋白、酪蛋白、牛血清白蛋白等)因素均可能诱发本病。
一、主要病因
1、细菌、病毒感染：本病患者常见于上呼吸道感染后1~3天，或肠道感染、泌尿系感染等病史，这是因呼吸道及肠道黏膜免疫异常，导致大量IgA免疫复合物通过血液循环在肾脏内聚集而致病。
2、遗传：从流行病学来看，IgA肾病具有种族、地区及家族遗传性的特点。
3、继发性：部分IgA肾病可继发于乙肝肝硬化、儿童过敏性紫癜、儿童系统性红斑狼疮等疾病，出现这种情况可能与自身免疫功能异常相关。
二、诱发因素
1、最常见为上呼吸道感染，多为病毒感染如流感A病毒、EB病毒、水痘病毒、肠道病毒等;其它黏膜感染包括胃肠道、泌尿道感染。
2、还可在进食某些含有卵白蛋白、酪蛋白、牛血清白蛋白等蛋白质的食物，受凉，过度劳累等因素影响下出现。