滤泡性结膜炎的病因和发病机制极为复杂，至今未完全阐明。一般认为是对某种微生物抗原的一种迟发性超敏反应，主要是对结核菌素蛋白和金黄色葡萄球菌的蛋白质过敏，无传染性。本病好发于儿童、青少年、女性，营养不良、卫生条件差、身体虚弱、挑食等人群容易诱发本病，活动性睑眼缘、急性结膜炎等患者也容易诱发本病。
一、主要病因
泡性角结膜炎的发生，新的观点多认为是一种感染免疫机制，由多种微生蛋白质，如细菌中的结核菌素、金黄色葡萄球菌蛋白及真菌、衣原体或寄生虫蛋白质引起的迟发性变态反应。当微生蛋白等抗原进人机体后，产生抗体使T细胞过敏并使其增殖，使机体处于过敏状态，及引起过敏的淋巴细胞再次受到同抗原时，过敏淋巴细胞一方面直接杀伤带有抗原的细胞，同时释放各种淋巴因子引起局部反应，形成由单核细胞、巨噬细胞和淋巴细胞组成的疱疹。
二、诱发因素
1、环境因素：卫生条件差、阴暗潮湿的居住环境容易诱发泡性结膜炎。
2、疾病因素：急性细菌性结膜炎、活动性睑眼缘等眼部炎症性病变也容易诱发泡性结膜炎。