不同的脑炎，预后是不同的，有的致死率高，有的经过积极、有效的治疗后，会战胜病魔，但是会遗留一定的后遗症。如单纯疱疹病毒性脑炎，它的预后取决于疾病的严重程度和治疗是否及时，它的死亡率达到60%～80%，约10%的患者会遗留后遗症，包括不同程度的瘫痪、智力减退、语言含糊、不流利等。亚急性硬化性全脑炎和进行性风疹全脑炎，目前还没有特效的治疗方法，患者多在短时间内死亡。化脓性脑膜炎和结核性脑膜炎，病死率和致残率都很高，后遗症包括智力减退、癫痫、脑积水、共济失调、行走不稳等。因此，不同类型的脑膜炎，要么患者治疗无效而死亡，要么挽救了生命，但是遗留有智力障碍、语言功能障碍和运动功能障碍等后遗症。