甲减的诊断主要根据临床表现以及甲状腺激素测定的水平，由于不同的地区，不同的医院采取不同的仪器，以及检测的方法不一样，检测的正常的范围也有不同。甲状腺功能减退根据临床表现高度怀疑，可能进一步进行甲状腺激素的测定，甲状腺激素测定的水平，T3、T4或者游离T3游离、T4明显的降低，而促甲状腺激素水平可能会增高或者降低，可以诊断为甲状腺功能减退。
甲状腺功能减退临床症状上没有特异性，主要是根据生化检查，即甲状腺激素的测定，诊断为甲减以后，再需要进行定位，甲状腺功能减退到底是甲状腺本身出问题，还是上级管理部门垂体出现问题，这种叫继发性的甲状腺功能减退，比如脑垂体由于外伤、手术受到了损伤，造成促甲状腺激素分泌减少，也可以出现甲减。化验检查主要表现的是促甲状腺激素偏低，而甲状腺激素的水平偏低，除了出现继发性甲减以外，同时可能合并相应的肾上腺皮质功能减退，以及性腺功能的减退。
临床最常见的是发生在甲状腺的甲状腺功能减退，病因上包括甲状腺的手术，或者甲状腺由于放射性的损伤，自身免疫性的甲状腺炎是引起甲状腺功能减退的原因。虽然能查到造成甲状腺损伤的各种原因，但是甲减的治疗是一样的，要进行甲状腺激素的替代治疗，选用左甲状腺素钠片，在医生的指导下选择合理的剂量，定期复查，评估疗效和安全性。