小儿蛔虫病的治疗主要是驱虫治疗和并发症治疗，一般1~3天，有并发症或严重感染者治疗时间延长。
一、药物治疗
1、甲苯咪唑：治疗蛔虫病的首选药物之一，为广谱驱虫药，能杀灭蛔虫、蛲虫、钩虫、鞭虫等，副作用小，偶见胃肠不适、腹泻、呕吐、头痛、头昏、皮疹、发热等。适用于集体驱虫或现场普治。
2、枸橼酸哌嗪：安全有效的抗蛔虫和蛲虫药物，适用于有并发症的患儿，不良反应轻微，毒性很小，但过量时可出现短暂的恶心、呕吐、腹痛、荨麻疹、震颤、共济失调等，肝肾功能不良及癫痫患儿禁用。在肠梗阻时最好不用，以免引起虫体骚动。
3、左旋咪唑：广谱驱肠虫药，口服吸收快，由肠道排泄，无蓄积中毒，驱蛔效果达90%~100%，对钩虫、蛲虫也有效，同时也是免疫调节剂，可恢复细胞免疫功能，不良反应轻微，可有头痛、恶心、呕吐、腹痛，偶有白细胞计数减少、肝功损害、皮疹等，肝肾功能不良者慎用。
4、阿苯达唑：广谱杀虫剂，治愈率可达96%，不良反应轻微，少数可有口干、乏力、头晕、头痛、食欲减退、恶心、腹痛、腹胀等，一般可自行缓解，孕妇及2岁以内儿童慎用。
二、手术治疗
该病一般无需手术治疗。
三、中医治疗
1、分证论治：
（1）肠蛔虫证：
（1）治法：驱蛔杀虫，调理脾胃。
（2）主方：使君子散加减。
（3）常用药：使君子、芜荑、苦楝皮、槟榔、甘草、厚朴、花椒、青皮等。
（4）加减：腹痛明显者，加川楝子、延胡索、木香；腹胀满，大便干者，加大黄(后下)、玄明粉(冲服)；呕吐者，加竹茹、生姜。
（2）蛔厥证：
（1）治法：安蛔定痛，配合驱蛔。
（2）主方：乌梅丸加减。
（3）常用药：乌梅、细辛、花椒、黄连、黄柏、干姜、附子煎)、桂枝、当归、党参、延胡索、白芍等。
（4）加减：初起腹部绞痛、面色苍白、四肢厥冷者，去黄连、黄柏，加木香、枳壳；便秘腹胀者，加大黄(后下)、玄明粉(冲服)、枳实；湿热壅盛，胆汁外溢出现黄疸者，去干姜、附子、桂枝等温燥之品，酌加茵陈、栀子、郁金、黄芩、大黄(后下)。若为胆道死蛔，不必先安蛔，可直接予大承气汤加茵陈治疗。
（3）虫瘕证：治法：通腑散结，驱蛔下虫。
主方：驱蛔承气汤加减。
常用药：大黄(后下)、玄明粉(冲服)、枳实、厚朴、乌梅、花椒、使君子、苦楝皮、槟榔、木香等。
早期先考虑药物治疗，疼痛缓解后予驱虫治疗；若完全梗阻，出现腹硬、压痛、腹部闻及金属样肠鸣音或气过水声，应及时手术治疗。
（4）脾虚虫积证：
（1）治法：健脾杀虫，运脾消积。
（2）主方：布袋丸加减。
（3）常用药：党参、白术、茯苓、甘草、使君子、芜荑、芦荟、神曲、青皮、陈皮、胡黄连、麦芽等。
（4）加减：腹胀明显者，加枳实、木香；烦躁不安，夜卧不宁者，加夜交藤、莲子心；大便稀溏者，加炮姜、肉豆蔻。
2、中成药治疗：
（1）使君子丸用于肠蛔虫证。
（2）乌梅丸用于蛔厥证。
3、针灸疗法：
（1）天枢、中脘、足三里、内关、阳陵泉，用于肠蛔虫证。
（2）迎香透四白、中脘透梁门、大横、胆俞、脾俞、足三里，用于蛔厥证。
四、其他治疗
1、并发症治疗：
（1）胆道蛔虫症：治疗原则为解痉止痛、驱虫、控制感染及纠正脱水、酸中毒和电解质紊乱，可选用中药乌梅丸等驱蛔。当内科治疗无效时可予以手术治疗。
（2）蛔虫性肠梗阻：不完全性肠梗阻可采用禁食、胃肠减压、输液、解痉、止痛等处理，疼痛缓解后可予驱虫治疗，完全性肠梗阻时应即时手术治疗。
（3）蛔虫性腹膜炎：一旦确诊，应及早手术治疗。
2、对症治疗：出现全身过敏症状时，用抗过敏药物，有腹痛时可用阿托品等。