内分泌检查首先要测定各种垂体和它管理的靶腺相关的功能水平，比如垂体、甲状腺、肾上腺、性腺功能是否正常，测定各种激素的水平，判断节律是否规整、正常。还会通过内分泌检查来判断各种代谢性的疾病，比如钙磷代谢，要检查甲状旁腺、维生素D和骨骼的情况，比如骨密度的检查。
另外需要了解糖代谢是否紊乱，比如测定胰岛功能和血糖是否匹配，是否有糖尿病的存在，不仅仅需要了解内分泌腺体功能是否正常，也需要了解内分泌腺体的形态是否增大，是否有肿瘤和炎症，通过CT、核磁或者超声，甚至是同位素的甲状腺扫描，来帮助判断甲状腺甚至垂体、肾上腺的形态是否有问题。