治疗革兰阴性杆菌感染首选的药物为喹诺酮类或者头孢三代、四代抗菌素，革兰阴性杆菌种类较多，比较常见的是大肠杆菌，伤寒沙门氏菌、绿脓杆菌、志贺杆菌属等，不同的抗菌素对各种细菌的敏感性是不相同的。最好根据药敏试验选择最敏感的抗生素，如果没有药敏试验，采用经验治疗时，革兰阴性杆菌可以选择喹诺酮类抗生素，如左氧氟沙星、环丙沙星、莫西沙星，头孢三代以上抗菌素，如头孢他啶、头孢哌酮、头孢曲松、头孢克肟等；患者还可以应用氨基糖苷类抗生素，如庆大霉素、依替米星，也可以选择半合成青霉素，如哌拉西林他唑巴坦。如果使用上述药物无效，还可以选择碳青霉烯类抗生素，如亚胺培南、美罗培南、厄他培南等。