1、常规检查：多数患者外周血象正常，少数患者是酸性粒细胞轻度升高。脑囊虫病颅内压升高型患者脑脊液压力明显升高，淋巴细胞增多，蛋白含量升高，糖和氯化物正常。
2、病原学检查：患者粪便中可找到虫卵，皮下及肌肉囊尾虫病患者可做皮下结节活检，找到猪囊尾蚴可直接确诊。
3、免疫学检查：常用于临床初筛或流行病学调查，检测短程特异性IgG4抗体具有较高的敏感性和特异性。
4、分子生物学检查：具有高度特异性和敏感性。
5、影像学检查：头脑CT及MRI检查对脑囊虫病诊断与定位具有重要价值，CT能显示直径小于1cm的囊性低密度灶，注射对比增加剂后，病灶周围可见环形增强带为包膜与炎症水肿区。
6、病理检查：皮下结节常规做活组织检查，病理切片中见到囊腔中含囊尾蚴头节可确诊。