性别认同障碍的预防在于学会积极的进行心理疏导。人们在遇到心理冲突时，尤其是内心承受能力较差的人在遇到心理冲突时，一定要及时地做好心理疏导，使自己的心理冲突能够得到及时的化解。
（1）学会积极的进行心理疏导。
（2）出现不认同自己生理性别的行为时，家长应当积极干预。
（3）家长有意识的培养孩子的性别观念。
（4）购买符合孩子性别的衣服以及玩具。