晚睡强迫症的病因和发病机理至今尚未完全明了，可能与遗传、神经生物异常有关。可由夜间娱乐活动丰富、社会压力增加等心理社会因素而诱发，好发于青少年。
一、主要病因
1、遗传因素：患者与双亲的同病率约为5％~7％，远高于普通人群。
2、神经生物学因素：研究发现，患者脑脊液中5-羟色胺代谢物的浓度明显高于正常对照组，使用氯米帕治疗后代谢物明显降低。绝大多数抗强迫症药物均有抑制5-羟色胺摄取作用，提示强迫性晚睡患者存在5-羟色胺活动异常。虽然井非所有的研究结果都一致，但大多数研究结果表明强迫性晚睡患者存在眶额皮质、扣带回前部、基底部和丘脑等结构组织的神经解剖学环路异常。
二、诱发因素
1、负性情绪与事件：包括工作、生活环境的变迁，人际关系不佳，责任加重，家庭不和、亲人丧失和突然的惊吓等。
2、压抑的生活氛围：家庭中过分苛求、刻板、压抑的氛围，以及父母对孩子的过高期望及成就压力等因素，可能对形成强迫倾向及症状起到一定的作用。