阿加祛曲斑是一种凝血酶抑制剂，可以与凝血酶活性位点结合发挥抗血栓的作用。通过抑制凝血酶催化和诱导的反应，包括血纤维蛋白的形成、凝血因子的活化、蛋白C的活化及血小板聚集，发挥其抗凝作用，对凝血酶具有高度选择性。对与血凝块相连的凝血酶有抑制作用。与肝素诱导的抗体间没有相互作用。由于它可能会导致出血，所以对老年用药要减量。