吃哈密瓜喉咙疼多是由于哈密瓜含糖分较多，较甜，食用后可产生较多的酸性物质，可反流到咽喉部，造成对咽喉部黏膜的烧灼，进而造成咽喉部黏膜的充血、肿胀以及疼痛，一般还有咽异物感。一般有胃病史，饮食上需少吃或不吃酸甜食物，减少胃酸的产生，从而减少对咽喉部的烧灼。
检查时可见咽部黏膜一般无明显异常，间接喉镜检查提示杓区水肿、充血肿胀，通常给予抗酸药物治疗，如奥美拉唑等，还需加用中成药，如一清片，睡眠时尽量抬高枕头，避免胃酸反流。